清代国家机关档案，是了解和研究清代历史的宝贵资料。目前，除了绝大部分集中保存于中国第一历史档案馆外，还有部分分藏在海内外各档案馆、图书馆及博物馆。
海外清代档案史料分布情况
目前清代档案分藏在美国、英国、日本、俄罗斯、德国、法国、荷兰、加拿大等国家。各国主要收藏机构如下：
美国，国会图书馆、哈佛燕京图书馆、哥伦比亚大学东亚图书馆、加州伯克莱大学东亚图书馆、普林斯顿大学葛思德东亚图书馆、耶鲁大学东亚图书馆、斯坦福大学东亚图书馆、西雅图华盛顿大学东亚图书馆、北卡罗来纳大学威尔逊图书馆等。
英国，公共档案馆、国家档案馆、伦敦档案馆、大英图书馆、伦敦大学亚非研究学院图书馆、牛津大学波德兰图书馆、剑桥大学东方研究系图书馆、伦敦大学图书馆。
日本，国立国会图书馆、国立公文书馆、东洋文库。
俄罗斯，俄罗斯帝国对外政策档案馆、圣彼得堡俄罗斯国家历史档案馆、俄罗斯海军历史档案馆等。
《大清搢绅全书》（哥伦比亚大学东亚图书馆藏）
此外，法国国家档案馆、德国国家档案馆、荷兰国家档案馆、莱顿大学图书馆、意大利罗马国家档案馆、加拿大国家档案馆、澳大利亚国家档案馆，均收藏有清代档案。
海外清代档案史料存藏举例
由于海外存藏分散，现择其较具特色一二家列举说明：
哥伦比亚大学东亚图书馆，其起源可追溯至1902年，距今已有110余年的历史，在北美以收藏中国地方志、文学作品和家谱档案著称，善本书及特别收藏以中文为主，大量清代资料为哥伦比亚大学独有。
哥伦比亚大学东亚图书馆收藏的资料：
专题史料
《中国近代教育史料汇编（晚清卷）》
《清宪政编查馆奏稿汇订》
《晚清民初西藏事务密档》
《清内务府档案文献汇编》
《中日甲午战争奏稿》
《晚清民国对外商事贸易统计资料》
《稀见中英鸦片战争密奏》
《清代六部文案手折》
《清代八旗史料汇编》
《清末民初（未刊）府州县清档》
《清蒙古事宜折奏文书》
《清代黄河流域洪涝档案史料》
地方志、家谱
法律史资料
《秋审比较条款附案》
《历朝折狱纂要》
《秋审实缓比较成案》
《秋讞辑要》
《馆稿节钞》
《学案初模》
《学案续编》
《驳案续编》
《各省秋审》
《新例要览》
《刑案成式》
《刑部说帖揭要》
《（大理院判解）新刑律集览》
晚清一系列小册子
中日甲午战争议和小册4种
蒙古新疆西藏小册
教育小册汇辑
清季铁路小册8种
清末官制吏治小册8种
清季实业小册10种
清季刑法小册3种
清季时事新政小册3种
传记行述汇辑218卷，如传、列传、家传、行述、行状、行略、事略、事状、事实、事迹备刻等
珍贵史籍
慈禧太后所赠开馆之书《古今图书集成》5044册
《大清搢绅全书》（搢绅录）892卷，嘉庆癸亥年至民国十七年（1803-1928年）
《时宪书》114卷，嘉庆元年至民国元年（1796-1912年）
《京师全图》（哈佛燕京图书馆藏）
加州伯克莱大学东亚图书馆，1947年开馆，其收藏强项是中国历史、文学、哲学、宗教及艺术史方面的经典作品。例如清代出版物，光绪朝钦定大清会典、国朝文录、大清通礼等。通过近年该馆出版物，如伯克莱加州大学东亚图书馆中文古籍善本书志（2005）、伯克莱加州大学东亚图书馆藏稿钞校本丛刊（2006，2013）、伯克莱加州大学东亚图书馆藏碑帖（2008）等，我们也能获取大量资料线索。
此外，该馆还藏有收集自世界各地图书馆和档案馆的关于18至20世纪中国、美国及太平洋地区贸易文化交流方面的资料，包括航海日志、日记、信件、账簿、贸易物品记录、价格记录、地图等丰富的一手资料，是研究18至20世纪中国对外贸易，乃至跨太平洋及世界范围内商业、航海等社会经济各方面的珍贵史料。
哈佛燕京图书馆，1928年开馆，至今已有将近90年的历史，是中国本土以外东亚研究中最大的大学图书馆。该馆所藏清代档案资料年代跨度很大，从清初到清末均有存藏；且形制多样，有舆图、簿册、折件等。如《京师全图》《大清万年一统地理全图》《盛京内务府顺治年间档册》《批折旧式》《正红旗奏折》等。
其中彩印本舆图及图说可谓各有特色，十分珍贵。舆图不同于文字类文献，以地图与文字相结合的方式清晰描绘疆域、山脉、河流、街道、城市、建筑等，包含政治、经济、地理、历史、文化等多重信息，在文献利用上有不可替代的价值。如疆域图、水系图、城市图，信息量丰富，对于研究清代疆域、城市、山川地理均有重要参考价值。
海外所藏相当数量的清代档案资料，为中国乃至东亚近代、现代历史研究提供了丰富的史料。
