黑龙江将军衙门，是清代黑龙江地区驻防八旗的最高军事机关，设立于康熙二十二年，并兼管地方行政。下辖齐齐哈尔、黑龙江、墨尔根、呼兰、呼伦贝尔、布特哈、通肯七处副都统衙门与兴安总管衙门。除将军、副都统外，还设有协领、佐领、骁骑校、前锋、护军等官员以及相应数量驻防八旗官兵。此外，黑龙江将军治下还有水师营、火器营等。档案以满文为主，仅有少量汉文。文种有谕旨、移文、呈文、奏折、题本、咨文、札文等。目前，黑龙江将军衙门全宗原纸质档案多数存于黑龙江省档案馆，一史馆存有少数。